- 1942: El colegio fue cerrado por orden del presidente Eduardo Santos en enero de 1942, al igual que los colegios alemanes de Barranquilla, Cali y Medellín. Los bienes del colegio fueron expropiados por el Fondo de Estabilización del Banco de la República.Don Walter Held, designado presidente por el propio don Anton Kraus en 1941, tomó en sus manos la enorme responsabilidad de guiar los destinos del colegio y proteger su patrimonio material y moral durante los difíciles años de la guerra. Las clases escolares de la primaria se mantuvieron en diferentes residencias de la comunidad alemana.
- 1947: En 1947 el Doctor Fritz Müller, director del colegio desde 1938, fundó con el apoyo de don Reinhard Kling un colegio privado bajo el nombre neutral de Colegio Andino.
- 1948: Tras largas negociaciones, en 1948 el gobierno colombiano, en un acto de justicia, devolvió los bienes del Colegio Alemán al Deutscher Schulverein. Los miembros del Schulverein se reagruparon y cambiaron su nombre por el de Corporación Cultural Alejandro von Humboldt, la cual se hizo cargo de la dirección del nuevo colegio.La Junta Directiva de esta corporación, bajo la presidencia del señor Pablo Bickenbach, vendió los bienes del antiguo Colegio Alemán de la calle 20 y desarrolló el proyecto de construcción de un colegio moderno de amplia escala en los terrenos de la carrera 11 con calle 82.